Požadavky na urgentní vyšetření v mikrobiologii

Vyšetření STATIM se provádějí v odůvodněných případech, kdy jde o nebezpečí z prodlení, vyšetří se ihned po dodání a výsledky (pozitivní i negativní) jsou vždy hlášeny telefonicky tomu, kdo vyšetření požadoval.

Žádanka musí být podepsána lékařem, který vyšetření indikuje, musí obsahovat požadavek STATIM.

Urgentní vyšetření v mikrobiologii jsou velmi specifická, proto je vhodná předchozí telefonická konzultace k jasnému ozřejmění požadavku, k poradě, jaké vyšetření použít – nejčastěji stanovení antigenů očekávaných patogenů či PCR vyšetření apod.

Pokud se v naší laboratoři požadovaná urgentní vyšetření nedělají, poradíme provádějící laboratoř.

Po domluvě s ošetřujícími lékaři jsme připraveni zavádět další urgentní vyšetření tak, aby byla možná rychlá diagnostika onemocnění pacienta.

Kultivační vyšetření obecně nelze požadovat ve statimovém režimu.

Mohou být k dispozici pozitivní předběžné výsledky, kdy etiologický původce onemocnění (patogen) může být zjištěn dříve, než je kultivační vyšetření uzavřeno.

V případě závažných nálezů (v likvoru, hemokultuře, při epidemiích střevních, při závažném stavu pacienta apod.) laboratoř hlásí předběžné pozitivní výsledky aktivně sama – většinou telefonicky, či formou tzv. mezivýsledků do Nemocničního informačního systému (KIS).

U ostatních vyšetření po předchozí domluvě s indikujícím lékařem.

Předběžné negativní kultivační výsledky určit nelze, vždy se musí respektovat doporučená délka kultivace jednotlivých materiálů a očekávaných (či vylučovaných) patogenů.

Urgentní metody v mikrobiologii spočívají hlavně v rychlém průkazu antigenů, ev. nukleových kyselin (NK) hledaného patogena (resp. toxinu) přítomného v dodaném vzorku. Komerční firmy dnes nabízejí velké množství rychlých testů na bázi PCR, imunochromatografie apod.

Výsledek takového vyšetření je ale nutno interpretovat v kontextu s ostatními výsledky pacienta a jeho klinickým stavem.

Tyto metody hovoří o přítomnosti (či nepřítomnosti) antigenu, NK potenciálních patogenů, ale většinou nehovoří o životaschopnosti či patogenitě mikroorganismu.

Po tzv. rychlé metodě, která určí kultivovatelného patogena, by měla následovat klasická kultivace k získání čisté kultury bakterie a k možnosti stanovit citlivost na ATB (obzvláště platí pro mykobakteriologii).

OLM nabízí tato urgentní vyšetření:

• průkaz antigenů – výsledek do 1 hod od dodání vzorku do laboratoře

Neisseria meningitidis A, B, C, Y/W35, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pneumoniae, Escherichia coli K1, Haemophillus influenzae v likvoru – hlásí se vždy pozitivní i negativní výsledek

Helicobacter pylori, adenoviry, rotaviry, noroviry ve stolici - hlásí se pozitivní výsledek

Legionely, Str. pneumoniae v moči - hlásí se pozitivní výsledek

• průkaz toxinu A/B Clostridium difficile – výsledek do 1 hod od dodání vzorku do laboratoře

hlásí se vždy pozitivní výsledek

• mikroskopické vyšetření – výsledek do 2 hod od dodání vzorku do laboratoře

mikroskopie materiálu na BK (kromě moče, stěrů a výtěrů) – hlásí se vždy pozitivní výsledek

mikroskopie tekutého materiálu (hnis, výpotek, dialyzát) hlásí se na požádání

mikroskopie z hemokultury a likvoru hlásí se vždy pozitivní výsledek

mikroskopie duodenální šťávy na giardie (lamblie) – hlásí se na požádání

Mikrobiální obraz poševní (MOP) – hlásí se na požádání

• PCR

SARS-CoV-2

Influenza A, B + RSV

Clostridium difficile produkující toxin

Bordetella pertusis, Bordetella parapertussis

Mycoplasma pneumoniae

Chlamydophila pneumonie

Legionella pneumoniae

Streptococcus pneumoniae

Haemophilus influenzae

Mycobacterium tuberculosis komplex + rezistence na RIF a INH

• PCR – Multiplex

Ø Pneumonia panel – určuje semikvantitativní hodnocení patogena

Ø Respirační panel

Ø ME panel (meningitidis/encephalitis)

Ø Gastrointestinal panel

Ø BCID (pozitivní hemokultury)

podrobnosti viz: PCR - pokyny pro odběry

Doba vyšetření:

U vybraných PCR metod výše vyjmenovaných lze podle stavu pacienta zhotovit vyšetření urgentně. U většiny vyšetření lze zhotovit vyšetření v rychlém uzavřeném systému (GenExpert, FilmArray).

Pokud jde u pacienta o závažné a komplikované stavy (ARO, JIP), domluví se ošetřující lékař s mikrobiologem na optimálním postupu a na čase a způsobu dodání BM, na možnosti vyčkat do druhého dne apod.

Seznam metod prováděných v době pohotovosti (víkendy, svátky):

Při pohotovostním režimu laboratoře se zpracovávají veškeré doručené materiály.

ATB konzultace - dostupné v přítomnosti VŠ

všední dny od 7,00 do 15,30 hod

soboty, neděle, svátky od 7,00 do 12,00 hod